Kaupunki on läänin pääkaupunki ja useiden aluehallinnollisten ja valtionhallinnollisten elinten keskus. Näihin kuuluvat muun muassa Ruotsin maatalousvirasto, Ruotsin metsähallitus ja Tuomioistuinvirasto.
Jönköping on koko Etelä-Ruotsin logistinen keskus ja se on historiallisesti myös kaupan ja liiketoiminnan keskus. Tätä perinnettä vie nyt eteenpäin Elmian messukeskus, joka on tänään yksi tärkeimmistä kansallisten ja kansainvälisten konferenssien, tapahtumien ja kaupallisten messujen pitopaikoista. Hotelli- ja ravintolakapasiteetiltaan Jönköping lukeutuu neljännelle ja vastaavasti viidennelle sijalle Ruotsissa.
Jönköpingin kunta, joka on pinta-alaltaan noin 1,500 km², koostuu sekä pienistä että suurista taajamista, laajoista metsistä, vauraista maanviljelysseuduista monine järvineen ja jokineen. Alueella on houkuttelevia asuinsijoja sekä maaseudulla että kaupungissa. Jönköpingin kuntaan, joka perustettiin vuonna 1971, kuuluvat paikalliset aluekeskukset Huskvarna, Gränna, Visingsö, Skärstad, Lekeryd, Tenhult, Barnarp, Norrahammar, Månsarp, Bankeryd ja Norra Mo.