Le Conseil municipal définit les objectifs politiques de l´activité de la commune ainsi que le budget de la commune, ses plans économiques à long terme, etc. Le Conseil est formé de 81 députés. La majorité, Collaboration à Jönköping, dispose de 48 mandats. Les sociaux démocrates et le parti de gauche cumulent 33 mandats. Le Président est Anna Mårtensson (FP).
La Commission exécutive de la commune dirige et coordonne le travail pour réaliser les objectifs globaux de la commune, les directives et la gestion de l´activité communale. La Commission exécutive de la commune est formée de 15 délégués. Le Président de la commission est Acko Ankarberg Johansson (KD).
Outre le Conseil municipal et la Commission exécutive de la commune il y aussi 15 comités et 10 conseils régionaux.
Près de 500 personnes participent, à temps libre, à l´activité politique de la commune de Jönköping. Parmi ceux-ci 5 personnes, les conseillers municipaux, travaillent à temps plein à titre d´élus.